基于多目标优化的基因剪接位点识别

赵静 ^1,3，宋培明¹，骆建华^1,2*

¹上海交通大学生命科学技术学院, 上海200240

²上海生物信息技术研究中心, 上海 200002；³重庆后勤工程学院， 重庆400016

摘要 剪接位点识别是基因识别中的一个重要环节。目前方法有：隐马可夫模型、神经元网络、向量机等。但结果还远没令人满意。本文提出一种基于多目标优化的剪接位点识别算法。首先根据Exon-Intron数据库的序列特征和生物学知识，建立了接受位点模板、分支点模板以及接受位点和分支点距离的模板。并构造了接受位点函数、分支点函数和接受位点和分支点距离函数，建立了多目标优化模型，实现了多目标优化方法识别接受位点。实验结果表明，本方法较其它方法有较高的准确率，为剪接位点的识别提供了一种新方法。

关键词 多目标优化；剪接位点；识别