对微生物基因组中水平基因转移现象的探测与分析
时硕永,丁达夫
中科院上海生化细胞所
摘要 水平基因转移现象是指不同物种基因组之间交换遗传信息的现象,大量研究表明该过程是基因组进化中的重要动力。然而关于水平基因组转移的两个基本问题尚缺乏大规模的系统研究:那些功能类型的基因容易被水平转移以及水平基因转移如何影响代谢及调控网络的构成与进化。对这两个问题的研究将使我们能够进一步深刻理解水平基因转移机制。通过对82个基因组的分析,我们构建了一个新的水平基因转移数据库。在此基础上,我们采用对以上两个问题进行了深入研究,一些有意义的结果在本文中被发现并讨论。
关键词 生物信息学,比较基因组,基因组进化分析,水平基因转移